杭州市儿童医院是由杭州市人民政府按三级甲等标准全额投资建设的一所集医、教、研于一体的现代化综合性儿童医院。医院创建于2009年1月，总建筑面积约12万平方米，规模床位1000张。截止目前，共有职工700余人，其中高级职称120余人、硕博士200余人、博士生导师、硕士生导师20余人。年门诊达75余万人次，出院病人近2万人次。

医院专业设置齐全，专科特色明显，现有27个临床专科。小儿外科学、小儿呼吸病与感染性疾病学、临床认知心理学为杭州市重点学科，中医儿科学为杭州市重点培育学科。中医康复科、消化病学、骨科学为院级重点学科，泌尿外科学、内分泌学、皮肤病学、医院运维管理学为院级重点培育学科。专科建设涵盖儿童医疗各个领域，满足区域儿童常见病多发病、危重急症救治和康复服务需要。

医院坚持“科教兴院”，积极融入“长三角一体化”发展，与上海交通大学医学院附属新华医院全面开展医疗合作。围绕“杭州市儿童医学中心”“杭州市儿童保健中心”两个中心，谋求区域性合作、战略性发展。作为北京儿童医院集团成员单位、温州医科大学附属杭州市儿童医院、杭州师范大学附属儿童医院、浙江中医药大学附属杭州儿童医院以及杭州医学院教学医院，承担医学本科生、硕士研究生教学。现为浙江省儿科住院医师规范化培训基地，是浙江大学医学院附属儿童医院住培基地联合体成员，承担区域儿科住培任务。截止目前，医院获得国家自然科学基金委、省自然科学基金委、省科技厅、省卫健委、省中管局、市科技局和市卫健委等科研立项160余项。荣获浙江省医药卫生科技奖、杭州市科技进步奖等多个奖项，发表SCI论文30余篇，授权专利50余项。医院现为浙江省医学会小儿内科、外科分会的副主委单位，杭州市医学会小儿外科分会的主委单位。